東北大学 大学院医学系研究科 情報遺伝学分野 有馬隆博研究室

業績

業績

【論文、著書等（英文）】

  1. Okae H, Shibata S, Arima T. Common and unCommon findings in marmoset and human trophoblast stem cells. Cell Stem Cell. 31(10):1387-1388. 2024. doi: 10.1016/j.stem.2024.07.008.
  2. Shukla V, Moreno-Irusta A, Varberg KM, Kuna M, Iqbal K, Galligos AM, Aplin JD, Choudhury RH, Okae H, Arima T, Soares MJ. NOTUM-mediated WNT silencing drives extravillous trophoblast cell lineage development. Proc Natl Acad Sci U S A. 121(40):e2403003121, 2024. doi: 10.1073/pnas.2403003121.
  3. Shibata S, Endo S, Nagai L, Kobayashi E, Oike A, Kobayashi N, Kitamura A, Hori T, Nashimoto Y, Nakato R, Hamada H, Kaji H, Kikutake C, Suyama M, Saito M, Yaegashi N, Okae H, & Arima T. Modeling Embryo–Endometrial Interface Recapitulating Human Embryo Implantation. Science Advances. 10(8):eadi4819. 2024. doi: 10.1126/sciadv.adi4819.
  4. Hori T, Okae H, Shibata S, Kobayashi N, Kobayashi EH, Oike A, Arima T, Kaji H. Trophoblast stem cell-based organoid models of the human placental barrier. Nat Commun. 15(1):962. 2024. doi: 10.1038/s41467-024-45279-y.
  5. Shimizu T, Oike A, Eri H Kobayashi EH, Sekiya A, Kobayashi N, Shibata S, Hamada H, Saito M, Yaegashi N, Suyama M, Arima T, Okae H. CRISPR screening in human trophoblast stem cells reveals both shared and distinct aspects of human and mouse placental development. Proc Natl Acad Sci U S A. 19;120(51):e2311372120. 2023. doi: 10.1073/pnas.2311372120.
  6. Varberg KM, Dominguez EM, Koseva B, Varberg JM, McNally RP, Moreno-Irusta A, Wesley ER, Iqbal K, Cheung WA, Schwendinger-Schreck C, Smail C, Okae H, Arima T, Lydic M, Holoch K, Marsh C, Soares MJ, Grundberg E. Extravillous trophoblast cell lineage development is associated with active remodeling of the chromatin landscape. Nat Commun.10;14(1):4826. 2023. doi: 10.1038/s41467-023-40424-5.
  7. Frost JM, Amante SM, Okae H, Jones EM, Ashley B, Lewis RM, Cleal JK, Caley MP, Arima T, Branco MR. Regulation of human trophoblast gene expression by endogenous retroviruses. Nat. Struct. Mol. Biol. 30(4):527-538. 2023. doi: 10.1038/s41594-023-00960-6.
  8. Kuna M, Dhakal P, Iqbal K, Dominguez EM, Kent LN, Muto M, Moreno-Irusta A, Kozai K, Varberg KM, Okae H, Arima T, Sucov HM, Soares MJ. CITED2 is a conserved regulator of the uterine-placental interface. Proc Natl Acad Sci USA. 17;120(3):e2213622120. 2023. doi: 10.1073/pnas.2213622120.
  9. Jeyarajah MJ, Bhattad GJ, Kelly RD, Yang P, Okae H, Arima T and Renaud SJ. The multifaceted role of GCM1 during trophoblast differentiation in the human placenta. Proc Natl Acad Sci USA. 119(49):e2203071119. 2022. doi: 10.1073/pnas.2203071119.
  10. Kobayashi N, Okae H, Hiura H, Kubota N, Kobayashi HE, Shibata S, Oike A, Hori T, Kikutake C, Hamada H, Kaji H, Suyama M, Bortolin-Cavaillé M, Cavaillé J, Arima T. The microRNA cluster C19MC confers differentiation potential into trophoblast lineages upon human pluripotent stem cells. Nature Communications. 13(1):3071. 2022. doi: 10.1038/s41467-022-30775-w.
  11. Kobayashi EH, Shibata S, Oike A, Kobayashi N, Hamada H, Okae H, Arima T. Genomic imprinting in human placentation. Reprod Med Biol. 21(1):e12490. 2022. doi: 10.1002/rmb2.12490.
  12. Hada M, Miura H, Tanigawa A, Matoba S, Inoue K, Ogonuki N, Hirose M, Watanabe N, Nakato R, Fujiki K, Hasegawa A, Sakashita A, Okae H, Miura K, Shikata D, Arima T, Shirahige K, Hiratani I, Ogura A. Highly rigid H3.1/H3.2-H3K9me3 domains set a barrier for cell fate reprogramming in trophoblast stem cells. Genes & development. 36(1-2):84-102. 2022. doi: 10.1101/gad.348782.121.
  13. Muto M, Chakraborty D, arberg KM, Moreno-Irusta A, Iqbal K, Scott RL, McNally RP, Choudhury RH, Aplin JD, Okae H, Arima T, Matsumoto S, Ema M, Mast AE, Grundberg E, Soares MJ. Intersection of regulatory pathways controlling hemostasis and hemochorial placentation. Proc Natl Acad Sci USA. 14;118(50):e2111267118. 2021. doi: 10.1073/pnas.2111267118.
  14. Tando Y, Hiura H, Takehara A, Ito-Matsuoka Y, Arima T, Matsui Y. Epi-mutations for spermatogenic defects by maternal exposure to di(2-ethylhexyl) phthalate. eLife. 10:e70322. 2021. doi: 10.7554/eLife.70322.
  15. Varberg KM, Iqbal K, Muto M, Simon ME, Scott RL, Kozai K, Choudhury RH, Aplin JD, Biswell R, Gibson M, Okae H, Arima T, Vivian JL, Grundberg E, Soares MJ. ASCL2 reciprocally controls key trophoblast lineage decisions during hemochorial placenta development. Proc Natl Acad Sci USA. 118(10): e2016517118. 2021. doi: 10.1073/pnas.2016517118.
  16. Shibata S, H Kobayashi E, Kobayashi N, Oike A, Okae H, Arima T. Unique features and emerging in vitro models of human placental development. Reproductive Medicine and Biology. 19(4):301-313. 2020. doi: 10.1002/rmb2.12347.
  17. Hara-Isono K, Matsubara K, Mikami M, Arima T, Ogata T, Fukami M, Kagami M. Assisted reproductive technology represents a possible risk factor for development of epimutation-mediated imprinting disorders for mothers aged ≥ 30 years. Clinical Epigenetics. 22;12(1):111. 2020. doi: 10.1186/s13148-020-00900-x.
  18. Cinkornpumin JK, Kwon SY, Guo Y, Hossain I, Sirois J, Russett CS, Tseng HW, Okae H, Arima T, Duchaine TF, Liu W, Pastor WA. Naive Human Embryonic Stem Cells Can Give Rise to Cells With a Trophoblast-like Transcriptome and Methylome. Stem Cell Reports. 15(1):198-213. 2020. doi: 10.1016/j.stemcr.2020.06.003.
  19. Jaju Bhattad G, Jeyarajah MJ, McGill MG, Dumeaux V, Okae H, Arima T, Lajoie P, Bérubé NG, Renaud SJ. Histone deacetylase 1 and 2 drive differentiation and fusion of progenitor cells in human placental trophoblasts. Cell Death Dis. 4;11(5):311. 2020. doi: 10.1038/s41419-020-2500-6.
  20. Bhattacharya B, Home P, Ganguly A, Ray S, Ghosh A, Islam MR, French V, Marsh C, Gunewardena S, Okae H, Arima T, Paul S. Atypical protein kinase C iota (PKCλ/ι) ensures mammalian development by establishing the maternal-fetal exchange interface. Proc Natl Acad Sci USA. 23;117(25):14280-14291. 2020. doi: 10.1073/pnas.1920201117.
  21. Takahashi S, Okae H, Kobayashi N, Kitamura A, Kumada K, Yaegashi N, Arima T. Loss of p57KIP2 expression confers resistance to contact inhibition in human androgenetic trophoblast stem cells. Proc Natl Acad Sci USA. 116(52):26606-26613. 2019. doi: 10.1073/pnas.1916019116.
  22. Hattori H, Hiura H, Kitamura A, Miyauchi N, Kobayashi N, Takahashi S, Okae H, Kyono K, Kagami M, Ogata T, Arima T. Association of four imprinting disorders and ART. Clinical Epigenetics. 11(1):21. 2019. doi: 10.1186/s13148-019-0623-3.
  23. Okae H, Toh H, Sato T, Hiura H, Takahashi S, Shirane K, Kabayama Y, Suyama M, Sasaki H, Arima T. Derivation of Human Trophoblast Stem Cells. Cell Stem Cell. 22(1):50-63. 2018. doi: 10.1016/j.stem.2017.11.004.
  24. Sugimura S, Kobayashi N, Okae H, Yamanouchi T, Matsuda H, Kojima T, Yajima, Hashiyada Y, Kaneda M, Kan S, Imai K, Tanemura K, Arima T, Gilchrist RB. Transcriptomic signature of the follicular somatic compartment surrounding an oocyte with high developmental competence. Scientific Reports. 7(1):6815. 2017. doi: 10.1038/s41598-017-07039-5.
  25. Hiura H, Hattori H, Kobayashi N, Okae H, Chiba H, Miyauchi N, Kitamura A, Kikuchi H, Yoshida H, Arima T. Genome-wide microRNA expression profiling in placentae from frozen-thawed blastocyst transfer. Clinical Epigenetics. 9:79. 2017. doi: 10.1186/s13148-017-0379-6.
  26. Kobayashi N, Miyauchi N, Tatsuta N, Kitamura A, Okae H, Hiura H, Sato A, Utsunomiya T, Yaegashi N, Nakai K, Arima T. Factors associated with aberrant imprint methylation and oligozoospermia. Scientific Reports. 7:42336. 2017. doi: 10.1038/srep42336.
  27. Kobayashi N, Okae H, Hiura H, Chiba H, Shirakata Y, Hara K, Tanemura K, Arima T. Genome-Scale Assessment of Age-Related DNA Methylation Changes in Mouse Spermatozoa. PLoS One. 11(11):e0167127. 2016. doi: 10.1371/journal.pone.0167127.
  28. Stunnenberg HG; International Human Epigenome Consortium, Hirst M. The International Human Epigenome Consortium: A Blueprint for Scientific Collaboration and Discovery. Cell. 167(5):1145-1149. 2016. doi: 10.1016/j.cell.2016.11.007.
  29. Hamada H, Okae H, Toh H, Chiba H, Hiura H, Shirane K, Sato T, Suyama M, Yaegashi N, Sasaki H, Arima T. Allele-specific methylome and transcriptome analysis reveals widespread imprinting in the human placenta. Am J Hum Genet. 99(5):1045-1058. 2016. doi: 10.1016/j.ajhg.2016.08.021.
  30. Okae H, Matoba S, Nagashima T, Mizutani E, Inoue K, Ogonuki N, Chiba H, Funayama R, Tanaka S, Yaegashi N, Nakayama K, Sasaki H, Ogura A, Arima T. RNA sequencing-based identification of aberrant imprinting in cloned mice. Hum Mol Genet. 23(4): 992-1001. 2014. doi: 10.1093/hmg/ddt495.
  31. Okae H, Chiba H, Hiura H, Hamada H, Sato A, Utsunomiya T, Kikuchi H, Yoshida H, Tanaka A, Suyama M, Arima T. Genome-wide analysis of DNA methylation dynamics during early human development. PLoS Genetics. 10(12): e1004868. 2014. doi: 10.1371/journal.pgen.1004868.

【論文、著書等（日本語）】

  1. 柴田峻, 濱田裕貴, 有馬隆博. ゲノムインプリンティングとヒト疾患. 産科と婦人科 92 (2), 152-158. 診断と治療社. 2025.
  2. 柴田峻, 有馬隆博. ヒト胚着床現象のin vitroでの再現. 医学のあゆみ. 291 (8), 621-622. 医歯薬出版. 2024.
  3. 柴田峻, 小林枝里, 有馬隆博. ヒト胚-母体多階層幹細胞オルガノイドモデルの作製. オルガノイド研究　～培養・作製、活用、臨床応用～. 87-97. 株式会社エヌ・ティー・エス. 2024.
  4. 柴田峻, 小林記緒, 岡江寛明, 有馬隆博. 胎盤発生と細胞運命決定機構. HORMONE FRONTIER IN GYNECOLOGY. 30(1), 29-36. メディカルレビュー社. 2023.
  5. 柴田峻, 小林枝里, 有馬隆博. 知っておきたいエピゲノムの基礎知識. 産婦人科の実際. 72(8), 781-786. 金原出版. 2023.
  6. 濱田裕貴, 宮内尚子, 有馬隆博. 受精卵・出生児・胎盤の遺伝子変異. 臨床婦人科産科. 76(11), 1134-1139. 医学書院. 2022.
  7. 服部裕充, 有馬隆博. 生殖医療とエピジェネティクス. スキルアップ　ARTラボ　生殖補助医療の必須知識とテクニック. 57-31. 中外医学社. 2022.
  8. 樋浦仁, 服部裕充, 有馬隆博. 生殖補助医療とエピゲノム疾患. 遺伝子医学MOOK36号. 2021年4月号. vol.36. 170-175. 株式会社メディカルドゥ.
  9. 柴田峻, 岡江寛明, 有馬隆博. ヒト胎盤発生と幹細胞. 生体の科学. 2021年4月号. 72(2), 155-159. 医学書院.
  10. 岡江寛明, 有馬隆博. ヒトにおける経世代エピゲノム. 実験医学. 2021年4月号 39(6), 896-901. 羊土社.
  11. 小林枝里, 岡江寛明, 有馬隆博. ヒト栄養膜幹細胞と病態－疾患の病態モデル－. HORMONE FRONTIER IN GYNECOLOGY. 2021年9月号. 28(3), 213-218. メディカルレビュー社.
  12. 大池輝, 小林枝里, 小林記緒, 柴田峻, 岡江寛明, 北村茜, 宮内尚子, 有馬隆博. ヒトTS細胞を用いた胎盤疾患モデルの構築. BIO Clinica. 2021年5月号. 36(5), 73-77. 北隆館／ニューサイエンス社.
  13. 樋浦仁, 服部裕充, 有馬隆博. 生殖補助医療とエピゲノム疾患. 遺伝子医学MOOK36号. 170-175. 株式会社メディカルドゥ. 2021.
  14. 柴田峻, 有馬隆博. ヒト胎盤発生と幹細胞. 生体の科学. 医学書院. 72(2), 155-159. 2021.
  15. 岡江寛明,有馬隆博. プラダー・ウィリ症候群. 指定難病ペデュア2019. 148(1), 299-300. 診断と治療社. 2019.
  16. 岡江寛明, 有馬隆博. 胎盤の遺伝子工学的応用（perinatal stem cell）. 基礎と臨床の両側面からみた胎盤学. 310-315. メジカルビュー社. 2019.
  17. 樋浦仁, 岡江寛明, 有馬隆博. ゲノムインプリンティング. Science and Practice『産科婦人科臨床』シリーズ1巻「生殖生理」. 1(7), 246-255. 中山書店. 2019.
  18. 宮内尚子, 服部裕充, 小林記緒, 樋浦仁, 有馬隆博. ART治療法における遺伝的安全性とリスク. 月刊細胞. 51(5), 249-252. ニューサイエンス社. 2019.
  19. 服部裕充, 小林記緒, 岡江寛明, 有馬隆博. 加齢によるエピジェネティクス変異. 高齢不妊診療ハンドブック. 22-28. 医学書院. 2019.
  20. 有馬隆博. ARTとエピジェネティクス. 日本周産期・新生児医学会雑誌53巻5号. 1520-1522. 日本周産期・新生児医学会. 2018.
  21. 岡江寛明, 有馬隆博. ヒトにおける栄養膜幹細胞の樹立. ライフサイエンス 新着論文レビュー. ライフサイエンス統合データベースセンター. 2018. DOI: 10.7875/first.author.2018.004
  22. 岡江寛明, 有馬隆博. ヒト栄養膜幹細胞の樹立. 実験医学. 36(8), 1375-1378. 羊土社. 2018.
  23. Hattori H, Hiura H, Kobayashi N, Takahashi S, Okae H, Arima T. Therapeutic approaches to imprinting diseases. Epigenetics in Human Disease, Second Edition. Academic Press. 6:861-876. 2018.

【プレスリリース】

  1. 2024年10月4日「マーモセット TS 細胞の樹立に関する Preview 論文を掲載 ヒト TS 細胞との違いや研究意義について概説」東北大学大学院医学系研究科発表
  2. 2024年2月26日「ヒト胚着床現象を高度に模倣することに世界で初めて成功 ―着床機序の解明や不妊治療法の開発に期待―」AMED、東北大学大学院医学系研究科、熊本大学発生医学研究所、東京大学定量生命科学研究所、東京医科歯科大学共同発表
  3. 2024年2月9日「生体内の胎盤を模倣したヒト胎盤オルガノイドの作製に成功―胎児に安全な創薬への利用に期待―」AMED、東北大学大学院医学系研究科、熊本大学発生医学研究所、東京医科歯科大学共同発表
  4. 2023年12月14日「ヒト胎盤の発生・分化を調節する新たな仕組みを解明 ―胎盤の異常を伴う周産期疾患の病態解明、治療法や予防手段の開発に期待―」AMED、東北大学大学院医学系研究科、熊本大学発生医学研究所共同発表
  5. 2022年6月3日「ヒト受精卵から胎盤が発生する仕組みを解明 ―生殖補助医療や再生医療への貢献に期待―」AMED、東北大学大学院医学系研究科共同発表
  6. 2019年12月3日「全胞状奇胎の原因を探る細胞モデルを作製 母体を絨毛がんから守るために」AMED、東北大学大学院医学系研究科、東北大学病院共同発表
  7. 2017年12月15日「ヒト胎盤幹細胞の樹立に世界で初めて成功―生殖医療・再生医療への貢献が期待―」AMED、東北大学大学院医学系研究科、九州大学生体防御医学研究所共同発表

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